维吾尔族的《十二木卡姆》产生于公元14～16世纪西域音乐的融汇时期，经过多次的整理、规范，才成为今天的 《十二木卡姆》。木卡姆的第一次规范，在公元16世纪。这一时期，我国西域城邦小国叶尔羌汗国的拉西德汗在位，他的妃子阿曼尼莎罕精于维吾尔音乐艺术。

她与当时的木卡姆大师卡迪尔汗一起，邀请各地熟悉木卡姆的民间艺人，对散失在民间的木卡姆进行了系统的搜集整理工作。

这一工作使维吾尔族木卡姆与其他民族木卡姆得到了区分第一次确定了十二木卡姆的规模形成了木卡姆特有的琼乃合曼、达斯坦和麦西莱甫三部分结构还重新确定了木卡姆的歌词。

第二次规范，是在19世纪清代光绪年间，由当时喀什噶尔的著名木卡姆艺术家艾里姆·赛里姆和莎车的民间艺人赛提瓦尔共同完成。

他俩对流行在喀什噶尔的木卡姆加以整理、规范，形成了规模更大的古典音乐舞蹈套曲，产生了“喀什十二木卡姆”。