内部控制系统的作用主要有提高会计信息资料的正确性和可靠性、保证生产和经管活动顺利进行、保护企业财产的安全完整、保证企业既定方针的贯彻执行、为审计工作提供良好基础。

1.提高会计信息资料的正确性和可靠性

企业决策层要想在瞬息万变的市场竞争中有效地管理经营企业，就必须及时掌握各种信息，以确保决策的正确性，并可以通过控制手段尽量提高所获信息的准确性和真实性。因此，建立内部控制系统可以提高会计信息的正确性和可靠性。

2.保证生产和经管活动顺利进行

内部控制系统通过确定职责分工，严格各种手续、制度、工艺流程、审批程序、检查监督手段等。可以有效地控制本单位生产和经营活动顺利进行、防止出现偏差，纠正失误和弊端，保证实现单位的经营目标。

3.保护企业财产的安全完整

财产物资是企业从事生产经营活动的物质基础。内部控制可以通过适当的方法对货币资金的收入、支出、结余以及各项财产物资的采购、验收、保管、领用、销售等活动进行控制、防止贪污、***、滥用、毁坏等不法行为，保证财产物资的安全完整。

4.保证企业既定方针的贯彻执行

企业决策层不但要制定管理经营方针、政策、制度，而且要狠抓贯彻执行。内部控制则可以通过袱定办法，审核批准，监督检查等手段促使全体职工贯彻和执行既定的方针、政策和制度，同时，可以促使企业领导和有关人员执行国家的方针、政策在遵守国家法规纪律的前提下认真贯彻企业的既定方针。

5.为审计工作提供良好基础

审计监督必须以真实可靠的会计信息为依据，检查错误，揭露弊端，评价经济责任和经济效益，而只有具备了完备的内部控制制度，才能保证信息的准确，资料的真实并为审计工作提供良好的基础。

内部控制系统，是指内部控创构成要素相互联系、相互制约而形成的有机整体。从内部控制理论近一个世纪的发展历程来看，内部控制的实施由内部牵制、内部会计控制和内部管理控制所构成；由于内部牵制融于内部会计控制和内部管理控制之中，内部控制系统演变为由内部会计控制和内部管理控制所构成，在内部控制中，内部会计控制与内部管理控制是一种并列关系。